Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
U2af2P26369 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms