Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms