Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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