Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms