Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms