Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VimP20152 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VimP20152 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VimP20152 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VimP20152 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VimP20152 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VimP20152 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VimP20152 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VimP20152 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VimP20152 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms