Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RargP18911 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RargP18911 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RargP18911 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RargP18911 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RargP18911 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms