Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18530 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18530 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18530 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18530 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18530 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms