Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18524 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18524 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms