Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RhoP15409 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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