Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calb1P12658 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms