Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Myod1P10085 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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