Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms