Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtaP09225 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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