Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnfP06804 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnfP06804 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TnfP06804 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TnfP06804 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TnfP06804 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TnfP06804 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms