Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06321 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06321 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06321 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06321 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06321 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06321 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06321 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06321 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms