Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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