Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01734 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01734 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01734 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01734 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms