Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01647 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01647 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01647 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01647 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01647 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01647 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01647 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms