Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp1O89090 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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