Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capns1O88456 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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