Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms