Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a1O88207 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms