Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Stra6O70491 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Stra6O70491 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Stra6O70491 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Stra6O70491 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Stra6O70491 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Stra6O70491 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stra6O70491 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stra6O70491 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stra6O70491 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stra6O70491 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stra6O70491 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms