Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms