Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Top3aO70157 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3aO70157 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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