Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms