Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms