Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajb6O54946 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms