Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn5O54942 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn5O54942 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn5O54942 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn5O54942 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms