Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CrxO54751 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms