Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Per1O35973 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Per1O35973 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Per1O35973 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Per1O35973 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Per1O35973 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms