Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptch2O35595 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ptch2O35595 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ptch2O35595 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ptch2O35595 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptch2O35595 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ptch2O35595 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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