Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnih1O35372 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnih1O35372 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms