Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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RrhO35214 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RrhO35214 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RrhO35214 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RrhO35214 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RrhO35214 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RrhO35214 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RrhO35214 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RrhO35214 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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RrhO35214 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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