Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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