Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ArxO35085 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ArxO35085 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ArxO35085 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms