Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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