Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-Q1O19441 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms