Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms