Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CckarO08786 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CckarO08786 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CckarO08786 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms