Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm20939L7N243 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm20939L7N243 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20939L7N243 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20939L7N243 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20939L7N243 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20939L7N243 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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