Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm2888K7N746 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms