Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm3453K7N724 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3453K7N724 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms