Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm10428J3QNV7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm10428J3QNV7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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