Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c2J3QNM1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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