Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Top6blJ3QMY9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Top6blJ3QMY9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top6blJ3QMY9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Top6blJ3QMY9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top6blJ3QMY9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top6blJ3QMY9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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