Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3415J3QMS8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3415J3QMS8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3415J3QMS8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3415J3QMS8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Gm3415J3QMS8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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