Protein–RNA interactions for Protein: J3QK27

Gm21693, Predicted gene, 21693, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21693J3QK27 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21693J3QK27 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21693J3QK27 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms