Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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